生物处理法主要通过生物菌体的絮凝、吸附和牛物的降解作用对废水中发色物质分离和降解。生物的絮凝和吸附作用属于物理过程。并不能使染料分子的结构发生化学变化，而生物的降解作用则是利用微生物酶氧化或还原染料分子，破坏其发色基团和不饱和键，并通过一系列氧化、还原、水解、化合过程，将染料最终降解为简单无机物.或转化成各种营养物或原牛质。处理过程主要有好氧处理、厌氧处理和厌氧一好氧处理3种。其中，好氧处理方法使用得最多，厌氧一好氧法是近几年针对印染废水特点新开发的一种方法。好氧处理法因其效果较好而应用广泛。相对于厌氧处理法，好氧处理法不产牛臭味。厌氧生物处理法在一定条件下能够对复杂大分子物质有明显的降解效果，是一种很有发展前途的丁业废水处理方法。但厌氧法处理产生的工业废水经常伴随腐臭味，且单独运用时效果也不理想。所以，国内外对单纯的厌氧处理丁艺研究得较少。任随周等通过细菌脱色酶TpmD酶学特性研究，发现TpmD对结品紫、碱性品红、灿烂绿和孔雀绿4种三苯基甲烷类染料具有较强的脱色能力。E.Silveira等用假单胞菌属处理14种工业印染废水.结果表明，食油假单胞菌对其中的甲基橙、B15染料的脱色率达到80%以上，并且表现出较强的高浓度染料耐受性。
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